El desierto de Atacama, el desierto más seco y antiguo de la Tierra, alberga un fenómeno floral único conocido como el Desierto Florido, que ocurre esporádicamente en respuesta a eventos de lluvia raros. Ravenna es una especie endémica y en peligro de extinción del desierto de Atacama. Sin embargo, sus poblaciones están geográficamente restringidas y potencialmente vulnerables a la erosión genética debido a la aislamiento y las condiciones ambientales extremas. Este estudio tiene como objetivo evaluar la diversidad genética de las poblaciones y desarrollar marcadores de microsatélites utilizando tecnología de secuenciación de nueva generación (NGS). Se identificaron un total de 268 loci de microsatélites, y se desarrollaron con éxito 34 marcadores co-dominantes por primera vez. El análisis de diversidad genética utilizando ocho marcadores SSR etiquetados con fluorescencia reveló una baja diversidad genética en cuatro poblaciones, siendo la mayor diversidad observada en la población QCA, ubicada dentro del Parque Nacional Llanos de Challe, y la menor en la población TOTO, que está altamente expuesta a actividades antropogénicas. Los análisis UPGMA y STRUCTURE revelaron tres clústeres genéticos y una alta mezcla entre poblaciones, sugiriendo un flujo de genes histórico o en curso a pesar de la separación geográfica. La presencia de loci no polimórficos y bajos valores de PIC en algunos marcadores apoya aún más la limitada variación genética. Los nuevos marcadores de microsatélites desarrollados ofrecen una herramienta valiosa para futuros estudios genéticos, permitiendo el monitoreo de la diversidad genética e informando estrategias para la preservación de esta especie rara y ecológicamente significativa.