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Perfiles de expresión coordinada de microARN/mARN revelan mecanismos regulatorios únicos del color de piel en el salamandra gigante china

Autores: Guo, Yanjie; Wu, Weini; Yang, Xueyi

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Perfiles de expresión coordinada de microARN/mARN revelan mecanismos regulatorios únicos del color de piel en el salamandra gigante china


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Salamandra gigante china
Mercado de acuicultura
Individuos albinos
Transcriptoma
Formación de melanina
MiARNs

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 9

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El salamandra gigante china ha ganado popularidad en el mercado de la acuicultura en China en los últimos años. En el proceso de cría, encontramos que algunos individuos albinos eran extremadamente raros y no podían heredarse de manera estable, lo que limita severamente su comercialización en el mercado de acuicultura. En este estudio, realizamos análisis de secuenciación de transcriptoma y pequeños ARN (sRNA) en muestras de piel de tipo salvaje (WT) y albino (AL). En total, entre 5517 genes expresados diferencialmente (DEGs), 2911 DEGs estaban regulados a la baja en AL, incluyendo casi todos los genes clave involucrados en la formación de melanina. Un total de 25 miARNs se expresaron diferencialmente en AL en comparación con WT, de los cuales 17 estaban regulados al alza. A través del análisis integrado, no se encontró intersección entre los genes objetivo de los miARNs expresados diferencialmente y los genes clave para la formación de melanina. Los análisis de Ontología de Genes (GO) y de vías KEGG sobre DEGs mostraron que estos genes involucraban múltiples procesos relevantes para la síntesis de melanina y la vía de señalización clave MAPK. Curiosamente, los factores de transcripción SOX10 y PAX3 y la vía de señalización Wnt, que juegan un papel clave en otras especies, no fueron incluidos, mientras que los otros dos factores de transcripción de la familia SOX, SOX21 y SOX7, sí fueron incluidos. Después de analizar los genes clave para la formación de melanina, fue interesante notar una forma de empalme alternativo del en WT y una mutación crítica del gen en AL, que podría ser la principal razón del cambio de color de la piel de . Los resultados contribuyeron a entender el mecanismo molecular de la pigmentación de la piel en y acelerar el proceso de adquisición de individuos con colores corporales específicos por medios genéticos.

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