Los microplásticos son un grupo de contaminantes que está emergiendo rápidamente. Su presencia en el agua, sedimento y fauna acuática a nivel mundial plantea preguntas y preocupaciones sobre sus probables efectos en la vida acuática y la ecología. Este estudio investiga por primera vez la presencia, abundancia y tipos de microplásticos en el agua y sedimento de una laguna que bordea la gran aglomeración urbana de Lagos en Nigeria, y proporciona información adicional sobre la composición del sedimento. Se recolectaron muestras de agua y sedimento de cuatro ubicaciones en la Laguna de Lagos y un afluente. Se determinó la abundancia y distribución de microplásticos en cuatro clases de rango para las ubicaciones muestreadas. Las partículas de plástico se contaron utilizando microscopía digital, y se identificaron con Espectroscopia de Infrarrojo por Transformada de Fourier (FTIR) y Cromatografía de Gases-Masas por Pirólisis (GC-MS). La abundancia de microplásticos varió de 310 a 2319 partículas/kg en sedimento, y de 139 a 303 partículas/L en agua. La gran discrepancia en los sedimentos puede explicarse por las características del sedimento, ya que se detectaron más microplásticos en los sedimentos de grano fino de Makoko. Las fibras fueron la forma predominante encontrada en todas las muestras, seguidas de fragmentos y pocas películas. Las fibras fueron más abundantes en el agua (92.6%) que en los sedimentos (32.5%), mientras que más fragmentos y láminas ocurrieron en los sedimentos. Los polímeros más comúnmente utilizados, polipropileno y polietileno, también fueron los más detectados en ambas matrices. En comparación con otros estudios en Nigeria, nuestros hallazgos, especialmente en los sedimentos más gruesos, fueron más bajos, mientras que el sitio de grano fino reveló resultados similares.