Los microplásticos y nanoplásticos son abundantes en el medio ambiente. Se necesita más investigación para examinar las consecuencias de la contaminación por microplásticos en las especies vivas, dada su presencia generalizada. En nuestra investigación, determinamos los efectos tóxicos de los microplásticos de PET a niveles celular y genético. Nuestro estudio reveló una severa citotoxicidad en el intestino medio de las larvas y la inducción de estrés oxidativo después de 24 y 48 horas de tratamiento, como lo indican los contenidos de proteína total y MDA. Por primera vez, se ha observado daño celular en las partes reproductivas de los ovarios de las moscas hembras, así como en las glándulas accesorias y testículos de las moscas machos. Además, se notó un declive en la salud reproductiva, lo que resultó en una disminución de la fertilidad entre las moscas. Al analizar genes relacionados con el estrés como 83, 70, 60 y 26, detectamos una expresión elevada de estos. Nuestro estudio identificó como un biomarcador específico para detectar cambios redox tempranos en las células causados por microplásticos de PET en todos los grupos tratados, ayudando a elucidar el mecanismo de defensa primario contra la toxicidad de los microplásticos de PET. Este estudio ofrece conocimientos fundamentales sobre las amenazas ambientales emergentes que representan los microplásticos, revelando alteraciones discernibles a nivel genético.