La última década ha revelado que la corteza oceánica ígnea alberga una biota más abundante y diversa de lo que se esperaba anteriormente. Estos ecosistemas profundos, poco explorados y alojados en rocas, dominaron la biosfera de la Tierra antes de que las plantas colonizaran la tierra en el Ordovícico, por lo que el registro fósil de los endolitos profundos contiene pistas invaluables sobre la vida temprana y el trabajo para descifrarlos necesita intensificarse. Aquí, presentamos microorganismos fosilizados encontrados en espacios porosos abiertos y sellados en lavas de almohada del Ophiolite de Troodos (91 Ma) en Chipre. Se infiere una interpretación fúngica sobre los microorganismos basada en características morfológicas características. Las condiciones geoquímicas se reconstruyen utilizando datos de mineralogía, inclusiones de fluidos y los propios fósiles. La mineralogía indica al menos tres eventos hidrotermales y un aumento continuo de temperatura y pH. La precipitación de 1) celadonita y saponita junto con la introducción microbiana fue seguida por 2) zeolitas de Na y Ca, lo que resultó en la adherencia de arcilla a los microorganismos como protección, y finalmente 3) los carbonatos de Ca resultaron en la fosilización final y preservación de los organismos in-situ. Descifrar el registro fósil de la biosfera profunda del subsuelo marino es una tarea desafiante, pero cuando tiene éxito, puede abrir puertas al pasado críptico de la vida.