Las amebas testáceas (TA) son componentes importantes de los ecosistemas del suelo, donde desempeñan un papel esencial en las redes alimentarias subterráneas. En este estudio, examinamos la composición de especies, la diversidad y la estructura de los ensamblajes de TA en suelos debajo de las copas de los árboles (microscale) en tres posiciones de pendiente (mesoscale) en parques urbanos subtropicales en Shenzhen, China. Se identificaron cuarenta y dos especies de TA pertenecientes a 18 géneros en 81 muestras. Los ensamblajes de TA fueron los más diversos y abundantes en el centro de la copa del árbol en comparación con otros hábitats bajo el árbol. La base de las colinas albergaba una mayor abundancia y diversidad de TA en comparación con las ubicaciones superiores a lo largo de las pendientes. La distribución de TA fue impulsada principalmente por las posiciones bajo la copa y en la ladera, pero no por condiciones ambientales elementales como el pH, el contenido de humedad y el grosor de la capa de hojarasca. Ninguno de estos factores fue suficiente para moldear la composición del ensamblaje de TA. Los hallazgos de nuestro estudio sugieren que en estudios regionales de eucariotas microbianos del suelo, se debe considerar tanto la heterogeneidad micro (es decir, bajo la copa) como la mesoscale (es decir, la posición en la pendiente).