La influencia de diferentes regiones en la estructura y los mecanismos de ensamblaje del microbioma intestinal de los animales ha sido de gran interés para los científicos. Este estudio investigó el microbioma intestinal de roedores recolectados en las provincias de Anhui y Hubei. Nuestro objetivo fue caracterizar las redes de coocurrencia bacteriana y elucidar los mecanismos de ensamblaje del microbiota intestinal en hospedadores conspecíficos a través de diferentes regiones geográficas. Encontramos que la región geográfica moldeó el microbioma intestinal de los roedores conspecíficos al alterar la diversidad alfa, las redes de coocurrencia y los procesos de ensamblaje. Sin embargo, se necesita un análisis adicional para determinar qué factor de las dos regiones geográficas es el principal que afecta el microbiota intestinal de las dos especies de roedores.