La infección de enfermedades transmitidas por el suelo tiene el potencial de modificar la exudación de raíces y el microbioma de la rizosfera. Sin embargo, el grado en que estas modificaciones ocurren en diversas historias de monocultivo sigue siendo inadecuadamente explorado. Este estudio muestreó plantas de ginseng americano (L.) sanas y enfermas bajo 1-4 años de monocultivo y analizó la composición de ácidos fenólicos mediante HPLC, la estructura del microbioma mediante técnica de secuenciación de alto rendimiento y la abundancia de patógenos mediante PCR cuantitativa. Primero, los patógenos fúngicos de y en el suelo de la rizosfera eran más abundantes en las plantas enfermas que en las sanas. Las plantas sanas de ginseng americano exudaron más ácido fenólico, especialmente ácido p-cumárico, en comparación con las plantas enfermas después de 1-2 años de monocultivo, mientras que esta diferencia disminuyó gradualmente con el aumento de los años de monocultivo. La abundancia de patógenos fue influenciada por la exudación de ácidos fenólicos, por ejemplo, ácidos fenólicos totales (r = -0.455), ácido p-cumárico (r = -0.465) y ácido salicílico (r = -0.417), y la prueba in vitro adicional confirmó que la concentración aumentada de ácido p-cumárico inhibió el crecimiento micelial de los patógenos aislados para la pudrición de raíces. Las plantas sanas tenían una mayor diversidad de microbioma bacteriano y fúngico de la rizosfera que las plantas enfermas solo después de un largo período de monocultivo. Nuestro estudio ha revelado que la historia de cultivo del ginseng americano ha alterado el efecto de la infección por patógenos en el microbiota de la rizosfera y la exudación de raíces.