Este artículo presenta características geoquímicas, mineralógicas y microbiológicas de cinco muestras de sedimentos de fondo modernos en la zona litoral del lago salado de alta montaña Issyk-Kul. El método de secuenciación del gen 16S rRNA muestra que la comunidad microbiana consiste en degradadores de carbono orgánico (representantes de los filos: , , y y familias y ), microorganismos fotosintéticos (representantes de , fototróficos , bacterias púrpuras de azufre y cianobacterias) y bacterias de las ramas reductoras del ciclo biogeoquímico del azufre (representantes de , y ). Se establece la participación de microorganismos en procesos en la formación de una serie de minerales autigénicos (calcita, pirita framboidal, barita y Si amorfo). La alta diversidad de comunidades microbianas indica la presencia de componentes orgánicos lábiles involucrados en procesos biogeoquímicos modernos en los sedimentos. La destrucción activa de materia orgánica comienza en la interfaz agua-sedimento.