Este estudio tiene como objetivo establecer la relación entre los parámetros ambientales y la diversidad, composición y función de las comunidades microbianas que predominan en cada etapa del compostaje conjunto de residuos alimentarios y agrícolas. Se utilizaron métodos basados en cultivos y métodos independientes de cultivo para investigar los cambios en la microbiota. Las condiciones favorables de alta humedad inicial y relación C/N causaron una disminución en la riqueza y biodiversidad de la microbiota cuando existían dichas condiciones. Durante la etapa termofílica, el número total de microorganismos aumentó, y se llevó a cabo la mineralización activa de la materia orgánica por miembros de los géneros , , , y . La comunidad fúngica fue sensible a cambios drásticos de temperatura. dominó entre los hongos durante la transición de la etapa mesofílica a la termofílica y durante el enfriamiento. La biodiversidad aumentó con el tiempo y estuvo asociada con la dinámica de los índices de germinación y nitrificación, de modo que cuanto más diversa sea la comunidad microbiana, mayores serán las propiedades del compost que estimulan el crecimiento y desarrollo de las plantas. La comunidad microbiana del compost maduro, junto con los nutrientes minerales de las plantas listos para el consumo y los compuestos húmicos, hacen de este compost un buen aditivo para el suelo.