La epilepsia es una de las enfermedades neurológicas complejas más prevalentes tanto en la especie canina como en la humana, siendo la forma idiopática su diagnóstico más común. Los microARN (miARN) son pequeñas moléculas de ARN no codificante que desempeñan un papel en los procesos de regulación genética y parecen ser un objetivo biológico prometedor para el control de convulsiones. Se ha informado que estas moléculas son componentes del contenido interno de exosomas, que son pequeñas vesículas extracelulares liberadas por las células. En este estudio, se aislaron muestras de exosomas del plasma de 23 perros, incluyendo 9 perros con epilepsia que responden al tratamiento, 6 perros con epilepsia resistente a fármacos y 8 perros de control. Los exosomas plasmáticos fueron caracterizados mediante microscopía electrónica de transmisión, análisis de seguimiento de nanopartículas y blotting en punto. Posteriormente, se aisló el contenido de ARN enriquecido en microARN de los exosomas y se realizó la cuantificación de miARN mediante PCR cuantitativa en tiempo real. Se evaluaron siete miARN circulantes que han sido descritos previamente en la literatura como posibles biomarcadores diagnósticos o pronósticos para la epilepsia. Observamos diferencias significativas en los niveles de miR-16 (< 0.001), miR-93-5p (< 0.001), miR-142 (< 0.001), miR-574 (< 0.01) y miR-27 (< 0.05) en perros con epilepsia refractaria en comparación con el grupo de control. En perros epilépticos sensibles a fármacos, miR-142 (< 0.01) mostró diferencias significativas en comparación con perros sanos. Además, también se encontraron niveles distintos de miR-16 (< 0.05), miR-93-5p (< 0.01), miR-132 (< 0.05) y miR-574 (< 0.05) entre perros epilépticos sensibles a fármacos y resistentes a fármacos. Nuestros resultados presentan los exosomas circulantes en plasma como una fuente ventajosa de biomarcadores epilépticos, destacando el potencial de los miARN como biomarcadores pronósticos y diagnósticos de la epilepsia idiopática canina.