Desde el descubrimiento de los microARN (miARN) en C. elegans en 1993, el campo de la investigación sobre miARN ha crecido rápidamente. Estas moléculas de ARN no codificantes de cadena sencilla trabajan, de manera canónica, en la fase post-transcripcional para regular la expresión de proteínas. Se sabe que los miARN regulan la infección viral y la consiguiente respuesta inmune del huésped. La investigación en evolución sugiere que los miARN son activos en el descubrimiento e investigación de terapéuticas y diagnósticos. En esta revisión, resumimos sucintamente los últimos hallazgos en (i) los mecanismos que sustentan la regulación de la infección viral por miARN, (ii) la regulación de la respuesta inmune del huésped a patógenos virales por miARN, (iii) diagnósticos y terapéuticas basados en miARN dirigidos a patógenos virales y desafíos, y (iv) patentes de miARN y el panorama del mercado. Nuestros hallazgos muestran que la expresión diferencial de miARN puede servir como un biomarcador pronóstico para infecciones virales en relación con la predicción de la gravedad o los efectos adversos para la salud asociados con enfermedades virales. Si bien hay un gran potencial de mercado para la tecnología de miARN, el enfoque novedoso de utilizar miméticos de miARN para mejorar la actividad antiviral o antagonistas para inhibir los miARN pro-virales ha sido un esfuerzo de investigación en curso. Quedan importantes obstáculos en términos de entrega de miARN, estabilidad, eficacia, seguridad/tolerancia y especificidad. Abordar estos desafíos puede allanar el camino para aprovechar todo el potencial de los miARN en la medicina moderna.