En los últimos 50 años, la información sobre el sistema inmunológico de los peces ha aumentado de manera importante, particularmente la relacionada con especies de marcado interés comercial (es decir, salmones, bacalaos, bagres, doradas), que ocupan una posición clave en el árbol filogenético de los vertebrados (es decir, Agnatha, Chondrichtyes, peces pulmonados) o representan modelos experimentales consolidados, como el pez cebra o el medaka. Sin embargo, la mayor parte de la información obtenida se basó en el análisis de secuencias genéticas con poca o ninguna información sobre la base celular de las respuestas inmunitarias. Aunque los peces con mandíbula contienen un timo y órganos linfo-hematopoyéticos equivalentes a la médula ósea de los mamíferos, pocos estudios han tenido en cuenta las relaciones presuntivas entre la organización de estos microentornos celulares y las capacidades inmunitarias conocidas del sistema inmunológico de los peces. En la revisión actual, analizamos este tema proporcionando información sobre: (1) Los orígenes de la linfopoyesis T y B en Agnatha y peces con mandíbula; (2) la notable organización del timo de los peces teleósteos; (3) la ocurrencia de numerosos órganos, aparentemente no relacionados, que albergan progenitores linfo-hematopoyéticos y, presumiblemente, linfopoyesis B; (4) la existencia de memoria inmunológica en peces en ausencia de centros germinales.