Este estudio planteó la hipótesis de que la fertilización a largo plazo altera la estructura porosa y la estabilidad de los agregados en suelo rojo de tierras altas. Se realizó un experimento de fertilización a largo plazo en Qiyang, Hunan, con tres tratamientos: sin fertilización (CK), fertilización con nitrógeno-fósforo-potasio (NPK) y fertilización con nitrógeno-fósforo-potasio combinado con estiércol de cerdo (NPKOM). Se utilizó la tecnología de escaneo por tomografía computarizada (CT) de rayos X para evaluar las estructuras porosas tridimensionales a escala de columna de suelo (diámetro de 50 mm y altura de 50 mm) y a escala de agregados (diámetro de 3-5 mm), junto con la evaluación de las propiedades físicas y químicas del suelo. Los resultados mostraron que el contenido de carbono orgánico del suelo (SOC) aumentó en un 44,8% en NPK y un 112,5% en NPKOM en comparación con CK. NPKOM mejoró la estabilidad de los agregados en un 51,6%, mientras que NPK no tuvo un efecto significativo. A escala de columna de suelo, NPK aumentó la porosidad total en un 13,7% pero redujo los poros más grandes (>0,06 mm), mientras que NPKOM disminuyó la porosidad total en un 7,8% y aumentó los poros más grandes. A escala de agregados, NPKOM aumentó la porosidad para poros >0,098 mm en 7,6 veces en comparación con CK y 9,5 veces en comparación con NPK. En conclusión, la fertilización a largo plazo con NPKOM mejora significativamente el SOC y la estabilidad de los agregados y promueve la formación de poros más grandes, a diferencia de NPK, que principalmente aumenta el SOC pero no mejora la estructura del suelo.