Las micotoxinas son metabolitos fúngicos secundarios, tóxicos para humanos, animales y plantas. Entre las cientos de micotoxinas conocidas, se considera que las aflatoxinas, la citrinina, la patulina, el ácido penicílico, el ácido tenuazónico, la ocratoxina A, las citocalasinas, la deoxinivalenol, los fumonisinas, la fusarina C, el ácido fusárico y la zearalenona son los tipos que más contaminan los granos de cereales. La mayoría de las micotoxinas en estos grupos son producidas por tres géneros fúngicos: , y . Estos metabolitos afectan principalmente la calidad de la semilla, la germinación, la viabilidad, el vigor de la plántula, el crecimiento de la raíz y el coleóptilo. Además, dado que los hongos responsables de la producción de estas micotoxinas suelen ser endófitos que infectan y colonizan tejidos vegetales vivos, la acumulación de micotoxinas en los tejidos vegetales a veces puede estar asociada al desarrollo de síntomas de enfermedades vegetales. La presencia de micotoxinas, incluso en ausencia de síntomas de enfermedad, puede tener efectos biológicos sutiles en la fisiología de las plantas. Varios estudios destacan los efectos tóxicos de las micotoxinas en animales y líneas celulares, pero se sabe poco sobre el modo de acción de la mayoría de estos metabolitos en las células vegetales. Las micotoxinas más importantes con efectos fitotóxicos y sus productores, además de su descubrimiento, se esbozan brevemente a continuación y se abordarán en este artículo.