Los recientes avances en técnicas in silico de alto rendimiento traducen datos experimentales en redes biológicas significativas a través de las cuales se comprende el papel de proteínas individuales, interacciones y sus funciones biológicas. El objetivo del estudio fue identificar miARNs diferencialmente expresados (DE) entre el embrión competente y alargado del día 16 de vacas normales y los embriones tubulares no competentes del día 16 de vacas repetidoras, asimilar los miARNs DE a sus genes objetivo y agrupar los genes objetivo según su función biológica utilizando métodos in silico. Los 84 miARNs específicos de bovino priorizados fueron investigados mediante RT-PCR, y los resultados mostraron que 19 estaban diferencialmente expresados (11 regulados al alza y 8 regulados a la baja) en los embriones competentes en comparación con los no competentes ( = 2 magnitudes). Los genes integrados de mayor rango de los miARNs DE predijeron varias funciones biológicas y moleculares, procesos celulares y vías de señalización. Además, el análisis de los grupos de genes categorizados mostró asociación con vías de señalización, activando o desactivando genes clave y factores de transcripción que regulan el desarrollo del embrión, la placenta y varios órganos. En conclusión, los miARNs altamente DE en el concepto bovino del día 16 regulaban la embriogénesis y el establecimiento del embarazo. Las interacciones miARN-mARN elucidada en este estudio se basaron principalmente en predicciones de bases de datos públicas. Por lo tanto, las regulaciones causales de estas interacciones y mecanismos requieren una caracterización funcional adicional.