La endosimbiosis puede considerarse un proceso evolutivo regresivo o degenerativo caracterizado a nivel genómico por la erosión y degeneración del genoma debido a una alta presión mutacional hacia las bases AT (adenina y timina). La complejidad genómica y biológica de los endosimbiontes debe ser menor que la de las bacterias de vida libre de las que evolucionaron. En el presente trabajo, contrastamos si dos métricas propuestas para medir la complejidad genómica en ambos tipos de bacterias reflejan su complejidad, esperando valores más altos en las bacterias de vida libre que en los endosimbiontes. Por otro lado, nos esforzamos por profundizar en los factores que contribuyen a la reducción de los valores métricos en los endosimbiontes, así como su eventual relación con seis parámetros genómicos asociados con la funcionalidad. Este estudio tuvo como objetivo probar la robustez de estas métricas propuestas en un escenario biológico bien conocido, como el proceso de endosimbiosis.