El marco regulatorio exhaustivo de la UE con respecto a los OMG tiene como objetivo prevenir daños a la salud humana y animal y al medio ambiente, y prevé el etiquetado y la trazabilidad. Las plantas y productos editados genéticamente entran en estas regulaciones de OMG de la UE, que deben implementarse en actividades de control de cumplimiento. Los métodos de detección de OMG actualmente utilizados por los laboratorios de control se basan en PCR en tiempo real, donde la especificidad y la sensibilidad son parámetros de rendimiento importantes. La edición del genoma permite la modificación dirigida de secuencias de nucleótidos en organismos, incluidas las plantas, y a menudo produce variantes de un solo nucleótido (SNV), que son la clase más desafiante de ediciones genómicas para detectar. Por lo tanto, el método de prueba debe cumplir con requisitos avanzados con respecto a la especificidad, que puede aumentarse modificando un método de PCR. Los sistemas de PCR digital logran una sensibilidad muy alta y tienen ventajas en la medición cuantitativa. Los métodos de secuenciación también pueden utilizarse para detectar modificaciones de ADN causadas por la edición del genoma. Mientras que la mayoría de los métodos de PCR se pueden llevar a cabo en un laboratorio de control con el equipo técnico y el personal existentes, el procesamiento de los datos de secuenciación requiere recursos adicionales y la experiencia bioinformática adecuada.