La creación de innovaciones en las empresas es un tema que tiene un lugar firme en la literatura científica, y los autores describen varios procedimientos y teorías del funcionamiento del proceso de innovación en las empresas. Una parte del proceso de innovación es la toma de decisiones. En el artículo, se presta atención a los resultados de la investigación sobre el proceso de toma de decisiones como una parte importante e integral del proceso de innovación. Los elementos del proceso de toma de decisiones y su impacto en la innovación representan un área de posible exploración y desarrollo de teorías sobre la toma de decisiones en el proceso de innovación. Es aquí donde hemos propuesto una metodología para la toma de decisiones en el proceso de innovación. La gestión de los procesos de innovación, de los cuales la toma de decisiones es una parte importante, proporciona múltiples puntos de error para las empresas. Las empresas experimentan errores debido a la falta de información o su uso indebido, la influencia de la comunicación y el tiempo, y también la falta de experiencia de los empleados. El objetivo de este documento es resaltar los diferentes criterios y enfoques de toma de decisiones en las actividades de innovación en las empresas eslovacas dentro del marco de la metodología desarrollada y los resultados de la encuesta.