La efectividad de la unificación de empresas en el clúster también está asociada con una alta incertidumbre y riesgos. Así, el desarrollo de enfoques teóricos e instrumentos metodológicos para la gestión eficiente de riesgos de las empresas en condiciones de asociación en clúster es una tarea científica urgente. La metodología de una evaluación integral de riesgos de la empresa clúster se basa en el uso del enfoque para construir un modelo funcional y objetivo de una empresa clúster, y se reduce a la búsqueda de una respuesta a la pregunta: ¿puede un evento cambiar el valor de un indicador de provisión de tal manera que esto conduzca a un deterioro en el indicador resultante en cada subsistema de la empresa? Con base en los resultados de la previsión de riesgos externos, se estableció que el grupo de riesgos estatales y globales, en particular, políticos, territoriales y financieros, se caracteriza por amenazas significativas para los próximos 5 años para las empresas clúster estudiadas. Propusimos y probamos una metodología para una evaluación integral de los riesgos de las empresas clúster, basada en un enfoque funcional y objetivo, según el cual una empresa clúster como sistema socioeconómico se considera como un conjunto de tres subsistemas básicos: gestión, producción y financiero-económico.