En los sistemas de información multi-escala, la información suele caracterizarse en múltiples escalas y niveles. Para facilitar el proceso computacional de los sistemas de información multi-escala, empleamos el método de matriz para representar los sistemas de información multi-escala y seleccionar la combinación óptima de escalas de sistemas de información multi-escala en este estudio. Para ello, primero describimos algunos conceptos importantes y propiedades de los sistemas de información utilizando algunas matrices relacionales. La matriz relacional se introduce luego en los sistemas de información multi-escala y se utiliza para describir algunos conceptos principales en los sistemas, incluyendo los conjuntos aproximados inferior y superior y la consistencia de los sistemas. Además, desde la perspectiva de la matriz de relación, se define la importancia de la escala para describir la escala óptima global y la escala óptima local de los sistemas de información multi-escala. Finalmente, la matriz relacional se utiliza para calcular la importancia de la escala y construir los algoritmos de selección de escala óptima. La eficiencia de estos algoritmos se examina mediante varios ejemplos y experimentos prácticos.