La metionina es un aminoácido esencial que inicia la síntesis de proteínas y sirve como sustrato para diversas reacciones químicas. El metabolismo de la metionina juega un papel importante en la germinación de semillas, pero cómo funciona la metionina en la germinación de semillas de maíz no ha sido elucidado. Comparamos los cambios en la tasa de germinación, los contenidos de metionina y folatos, y los niveles de transcripción utilizando análisis de transcriptoma bajo tratamiento con agua o metionina exógena. Los resultados indican que la aplicación de metionina aumenta la tasa de germinación de semillas (95% frente a 70%), lo que lleva a diferencias significativas en el contenido de metionina a las 36 h, lo que adelantó el aumento rápido en 12 h en el embrión y el endospermo. El análisis de transcriptoma muestra que la metionina afecta principalmente la proliferación y diferenciación de células en el embrión, y la degradación de sustancias de almacenamiento y la transducción de señales en el endospermo. En particular, múltiples genes biosintéticos de fenilpropanoides fueron activados tras el tratamiento con metionina durante la germinación. Estos resultados proporcionan una base teórica para promover la germinación de semillas de maíz y sirven como un valioso recurso teórico para estrategias de pretratamiento de semillas.