La disponibilidad reducida de recursos hídricos en Egipto ha impuesto la necesidad de intensificar el uso de aguas residuales para la irrigación de cultivos en los suelos aluviales. Los efectos relevantes pueden derivar de los contenidos de metales potencialmente tóxicos (MPT) en los suelos de los recursos hídricos, cultivos y aguas subterráneas en estas áreas. Por esta razón, el contenido de MPT debe ser monitoreado para evaluar y minimizar los riesgos para la salud. Por lo tanto, en este contexto, se eligieron y compararon dos áreas del Delta del Nilo SE sometidas a 25 años de irrigación con aguas residuales, utilizando agua de drenaje agrícola (ADA) y aguas residuales mixtas (ARM), con un sitio cercano irrigado con agua dulce del Nilo (ADN). En cada uno de los tres sitios, se recolectaron y analizaron diez muestras de agua de riego, suelo superficial, plantas de trébol berseem (L.) y siete muestras de agua subterránea para Cr, Co, Cu, Pb, Ni y Zn. Los resultados indican que los contenidos totales de Co, Cu, Ni y Zn en los suelos recolectados de los tres sitios de muestreo y Pb en los suelos irrigados con ARM fueron más altos que sus contenidos naturales promedio en la corteza terrestre, lo que indica riesgos potenciales. Los contenidos extraíbles con DTPA de Cu en los tres sitios, además de Pb y Zn en los suelos irrigados con ARM, excedieron los límites seguros. Los suelos irrigados con ARM mostraron un grado considerable de contaminación por metales, mientras que los suelos irrigados con ADN y ADA mostraron niveles moderados y bajos de contaminación, respectivamente. Los contenidos de los seis MPT en los tres sitios mostraron bajos riesgos ecológicos individuales, excepto para Pb en los suelos irrigados con ARM que mostraron un riesgo moderado; sin embargo, el riesgo ecológico general siguió siendo bajo en todas las muestras. Los valores de Co, Cu y Ni en las hojas de berseem, además de Pb de los suelos irrigados con ARM, superaron los niveles máximos permitidos para la alimentación animal. Los valores del factor de translocación de raíz a hoja fueron inferiores a 1.0 para Cr, Co y Ni pero superiores a 1.0 para Cu, Pb y Zn. La planta de berseem es una buena candidata para la fitofiltración de Cr, Co y Ni, mientras que para extraer Cu, Pb y Zn de suelos contaminados. Las muestras de agua subterránea recolectadas de los tres sitios de muestreo mostraron concentraciones de metales más bajas que los límites seguros para los estándares de potabilidad. Se deben tener en cuenta estudios de remediación adicionales para mitigar posibles riesgos ambientales y relacionados con la salud al utilizar recursos hídricos diferentes al agua dulce.