Los frutos falsos de la manzana y la pera se consumen en todo el mundo, contribuyendo a la ingesta dietética de fitonutrientes antioxidantes que promueven la salud. Por ejemplo, los polifenoles confieren muchos efectos beneficiosos (según su estructura química, biodisponibilidad y eficiencia de absorción en el intestino) y el consumo de frutas de manzana y pera ricas en polifenoles puede, por lo tanto, reducir el riesgo de algunas enfermedades. Sin embargo, el contenido de tales moléculas depende en gran medida del cultivar específico de la fruta. Para examinar esta diversidad metabólica en detalle, utilizamos análisis metabolómicos (RMN y HPLC-DAD/MS) para perfilar el metaboloma de seis cultivares de manzana y cinco de pera. También determinamos la capacidad antioxidante de los extractos (ensayo FRAP) y correlacionamos esto con la composición metabolómica y la abundancia de metabolitos específicos. Observamos la acumulación específica de cultivares de azúcares, aminoácidos, ácido málico y varios polifenoles, lo que también se relacionó con la temporada de crecimiento para algunos cultivares. Encontramos que la antigua manzana italiana Pom Prussian estaba enriquecida en ácido clorogénico, así como en polifenoles más característicos (derivados de la florentina), el cultivar de pera Abate Fetel tenía bajo contenido de sacarosa, y ambos cultivares mostraron alta actividad antioxidante in vitro. Por lo tanto, estos cultivares pueden ser particularmente atractivos para los consumidores preocupados por la salud.