Varios estudios se han dedicado durante mucho tiempo a buscar microorganismos beneficiosos relacionados con las plantas, y sobre esta base, se ha encontrado que los hongos micorrízicos arbusculares (HMA) tienen un impacto positivo considerable en la salud de las plantas como agente fúngico biológico. En este estudio, nos centramos en los efectos de diferentes HMA en la dinámica de crecimiento y la configuración de raíces de la regaliz bajo condiciones salinas y alcalinas. Se evaluaron los metabolitos de la regaliz bajo diferentes HMA utilizando cromatografía líquida-espectrometría de masas en tándem (LC-MS/MS). (Fm) y (Ri) se añadieron como diferentes tratamientos de HMA, mientras que el suelo salino-alcalino esterilizado se trató como control. Se tomaron muestras en el período R1 (15 días después del tratamiento con HMA) y en el período R2 (45 días después del tratamiento con HMA). Los resultados mostraron que la aplicación de HMA aumentó significativamente el crecimiento de las raíces de la regaliz y aumentó significativamente la biomasa tanto del brote como de la raíz. Se detectaron un total de 978 metabolitos que se dividieron en 12 grupos, incluidos lípidos, que representaron el 15.44%; ácidos orgánicos y sus derivados, con un 5.83%; compuestos de benceno y compuestos heterocíclicos orgánicos, con un 5.42%; óxidos orgánicos, con un 3.78%; y cetonas, que representaron el 3.17%. En comparación con el control, hubo cambios significativos en los metabolitos diferenciales con el tratamiento inoculado con HMA; las rutas metabólicas y la biosíntesis de metabolitos secundarios fueron las principales rutas de enriquecimiento de metabolitos diferenciales en el período R1, y las del período R2 fueron el metabolismo microbiano en diversos entornos y la degradación de compuestos aromáticos. En conclusión, el uso de HMA como biofertilizante puede mejorar efectivamente el crecimiento de la regaliz, especialmente en términos de desarrollo de raíces y metabolitos, en condiciones de suelo salino-alcalino.