Stellaria Radix, llamada Yinchaihu en chino, es una medicina tradicional china, que se obtiene de las raíces secas de L. var. Bge. El yinchaihu cultivado (YCH) se ha convertido en una fuente principal de producción para aliviar la escasez de recursos vegetales silvestres, pero no está claro si los metabolitos del YCH cambian con el modo de producción. En este estudio, se comparan los contenidos de extractos de metanol, esteroles totales y flavonoides totales en YCH silvestre y cultivado. Los metabolitos se analizaron mediante cromatografía líquida de ultra alto rendimiento acoplada a espectrometría de masas de tiempo de vuelo. El contenido de extractos de metanol del YCH silvestre y cultivado superó el contenido estándar de la Farmacopea China. Sin embargo, los contenidos de esteroles totales y flavonoides totales en el YCH silvestre fueron significativamente más altos que los del YCH cultivado. En total, se identificaron 1586 metabolitos mediante espectrometría de masas, y 97 fueron significativamente diferentes entre las fuentes silvestres y cultivadas, incluyendo beta-sitosterol, derivados de quercetina, así como muchos componentes activos potenciales recién descubiertos, como trigonelina, arctiína y ácido logánico. Los resultados confirman que hay una rica diversidad de metabolitos en el YCH silvestre y cultivado, y proporcionan una guía teórica útil para la evaluación de la calidad en la producción de YCH.