La papa es un cultivo básico valioso que proporciona nutrición para una gran parte de la población humana en todo el mundo. Sin embargo, el proceso de domesticación redujo su resistencia a plagas y patógenos. Phytophthora infestans, el agente causal de la enfermedad del tizón tardío, es el patógeno más destructivo de las plantas de papa. Se han realizado esfuerzos considerables para desarrollar cultivares de papa resistentes al tizón tardío, pero el éxito ha sido limitado y la producción actual de papa requiere el uso extensivo de fungicidas. En esta revisión, resumimos las fuentes conocidas de resistencia al tizón tardío y los obstáculos en el control. Esbozamos los aspectos problemáticos del tratamiento químico, el posible uso del control biológico y los recursos disponibles de resistencia natural en accesiones silvestres. Nos centramos en posibles marcadores de resistencia que a menudo se pasan por alto en los estudios centrados en el genoma, incluidos metabolitos secundarios de las clases de alcaloides, fenilpropanoides y terpenoides, lípidos, proteínas y péptidos. Discutimos la idoneidad de estas moléculas para la selección asistida por marcadores y la posibilidad de aumentar la velocidad de la cría convencional de cultivares más resistentes.