Las variantes preseleccionadas asociadas con el rasgo de interés de los estudios de asociación del genoma completo (GWAS) están disponibles para mejorar la predicción genómica en cerdos. Los objetivos de este estudio fueron utilizar variantes preseleccionadas de un gran meta-análisis de GWAS para evaluar el impacto de las estrategias de preselección de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) en la predicción genómica de rasgos de crecimiento y de canal en cerdos. Genotipamos 1018 cerdos Large White utilizando matrices de SNP de medio (50k) y luego imputamos SNPs a nivel de secuencia utilizando un panel de referencia de 1602 muestras de secuenciación de genoma completo. Probamos los efectos de diferentes proporciones de SNPs seleccionados en las diferentes estrategias de preselección de SNP en la predicción genómica. Finalmente, comparamos las precisiones de predicción empleando la predicción lineal mejor ajustada genómica (GBLUP), BLUP de características genómicas y tres modelos GBLUP ponderados. Las estrategias de preselección de SNP mostraron una mejora promedio en la precisión que varió del 0.3 al 2% en comparación con los datos del chip de SNP. La precisión de la predicción genómica exhibió un patrón de aumento inicial seguido de una disminución, o una disminución continua a través de varias estrategias de preselección de SNP, a medida que aumentaba la proporción de SNPs seleccionados. El nivel más alto de precisión de predicción se observó al utilizar el 1 o el 5% de los SNPs principales. En comparación con el modelo GBLUP, la utilización de efectos de marcadores estimados de un meta-análisis de GWAS como pesos de SNP en el modelo BLUP|GA mejoró la precisión de la predicción genómica en diferentes estrategias de preselección de SNP. Las nuevas estrategias de preselección de SNP obtenidas de este estudio brindan oportunidades para la predicción genómica en poblaciones de tamaño limitado en cerdos.