En Ecuador, la minería de oro ilegal ha llevado a impactos ambientales significativos, con la liberación de elementos nocivos como el mercurio (Hg) en el medio ambiente. El mercurio, debido a sus características físico-químicas y a los elementos de transporte involucrados entre diferentes matrices ambientales, puede filtrarse fácilmente a través del suelo y alcanzar las aguas subterráneas. El propósito de este estudio fue evaluar los niveles de concentración de mercurio en la región andina para realizar una evaluación del riesgo para la salud humana. Para este propósito, se analizaron 175 muestras de agua, de las cuales el 9.71% superó el límite máximo permisible (LMP) establecido para el agua potable de acuerdo con la normativa ecuatoriana. El análisis de riesgo se llevó a cabo aplicando dos enfoques: determinista y probabilístico. El enfoque determinista implica un análisis específico basado en el cálculo del cociente de riesgo (HQ) y el índice de riesgo (HI) para ambos receptores (adultos y niños) y escenarios (residencial y recreativo) considerados; el enfoque probabilístico se basa en el uso de técnicas de simulación estocástica. Los resultados obtenidos de los dos enfoques muestran una discrepancia, siendo el análisis determinista más conservador; sin embargo, coinciden en mostrar un mayor riesgo para la población infantil; los tomadores de decisiones podrían utilizar estos resultados para identificar áreas a ser monitoreadas y planificar planes de investigación más detallados.