El algodón se cultiva ampliamente en regiones templadas de todo el mundo y a menudo se ve limitado por una ventana de siembra corta que está delimitada por temperaturas bajas y subóptimas. Con el creciente interés en la siembra temprana, será necesario mejorar la capacidad de germinación en frío del algodón para garantizar la estabilidad de la producción de los cultivos sembrados temprano. La importancia de los niveles de saturación de lípidos de membrana y almacenamiento en la mejora de la tolerancia al frío en las plantas, así como en la mejora de la capacidad de germinación en frío en las semillas, ha sido ampliamente investigada en una variedad de especies vegetales. Aunque estudios han demostrado que niveles más altos de lípidos insaturados pueden mejorar la capacidad de germinación en frío y reducir el daño de plántulas en otros cultivos, esfuerzos similares han sido bastante limitados en el algodón. Esta revisión analiza las propiedades funcionales de los lípidos de membrana y almacenamiento, y su papel en la estabilidad y reorganización de la membrana durante las primeras etapas de la germinación. Además, se describe la importancia de la composición de lípidos de almacenamiento como fuente de energía para el embrión en crecimiento en el contexto de la energética celular (es decir, el catabolismo de ácidos grasos). Finalmente, se presentan perspectivas para mejorar la germinación en frío del algodón de tierras altas mediante la manipulación de la composición de ácidos grasos tanto de los lípidos de membrana como de almacenamiento de las semillas.