Las enfermedades son los factores más importantes que reducen los rendimientos de cacahuetes en todo el mundo. En África Oriental, la mancha foliar tardía (LLS) y la enfermedad del mosaico del cacahuete (GRD) son las enfermedades más destructivas del cacahuete. La resistencia limitada está disponible en líneas de cacahuetes cultivados de pedigrí puro y se requieren nuevas fuentes de resistencia para producir variedades nuevas resistentes. En este trabajo, se fenotiparon 376 líneas interespecíficas de 3 poblaciones diferentes derivadas de cruces con la especie silvestre, , y para 2 temporadas y en 2 ubicaciones, Serere y Nakabango, en Uganda. Varios genotipos mostraron un mayor rendimiento, una semilla más grande, una floración más temprana y una resistencia similar a la de los cultivares locales. Los datos genotípicos se utilizaron para construir un mapa de ligamiento para la población AB-QTL que implica el cruce entre Fleur11 y [ x ]. Este mapa de ligamiento, junto con los datos fenotípicos, se utilizó para identificar loci de rasgos cuantitativos que controlan la resistencia a enfermedades. Estas líneas serán útiles para combinar buenos rasgos agronómicos y apilar resistencia a enfermedades para mejorar el cultivo de cacahuetes en África subsahariana.