Los fertilizantes químicos pueden mejorar la productividad de los cultivos, pero la fertilización irracional a menudo resulta en baja calidad y rendimiento de los cultivos, pobre fertilidad del suelo y grave contaminación ambiental. Sin embargo, se ha realizado poca investigación con un enfoque cercano en el cultivo de rábanos en regiones de alta montaña, un vegetal de raíz ampliamente cultivado conocido por su valor nutricional e importancia económica. Aquí, se propone un método para reducir los fertilizantes químicos combinados con la aplicación de fertilizantes orgánicos al estudiar cuatro ratios diferentes de fertilizantes químicos y orgánicos, incluyendo control (375 kg·ha de fertilizante químico + 4500 kg·ha de fertilizante orgánico) y combinaciones (T: 12% de reducción en fertilizante químico + 4500 kg·ha de fertilizante orgánico; T: 20% de reducción en fertilizante químico + 4500 kg·ha de fertilizante orgánico; T: 28% de reducción en fertilizante químico + 4500 kg·ha de fertilizante orgánico). Se investigaron sus efectos en la calidad, rendimiento y ambiente del suelo del rábano. En comparación con el grupo de control, T aumentó significativamente el rendimiento de rábano en un 12.92% y mejoró los contenidos de vitamina C, azúcares solubles, sólidos solubles de sulforafano y acidez titulable en las raíces de rábano en un 10.62%, 2.15%, 50.00%, 26.90% y 43.90%, respectivamente. El contenido de nutrientes del suelo aumentó con el tratamiento T, con un aumento del 7.69% y 14.29% en el contenido total de nitrógeno y fósforo total, respectivamente, en comparación con el control. Además, la actividad de ureasa, actividad de sacarasa, actividad de fosfatasa alcalina y actividad de catalasa del suelo fueron significativamente mejoradas por el tratamiento T, mostrando una mejora del 11.13%, 44.30%, 26.41% y 9.33% en comparación con el control, respectivamente ( < 0.05). La abundancia relativa de filos bacterianos beneficiosos como Proteobacteria y Actinobacteria aumentó en el tratamiento T, potencialmente ayudando a mantener una mejor salud del suelo y fertilidad a largo plazo. En resumen, se revela aquí una estrategia prometedora de manejo de fertilizantes a través de la reducción de fertilizantes químicos y la aplicación de fertilizante orgánico que no solo mejora el rendimiento y la calidad del rábano, sino que también optimiza el ambiente del suelo, proporcionando un medio efectivo para la producción sostenible de cultivos.