La fitorremediación de metales pesados (HMs) es una metodología eficiente para eliminar metales tóxicos del suelo. Por otro lado, los hongos micorrízicos arbusculares (AMF) se utilizan como fertilizantes biológicos, ya que mejoran la expansión de las raíces, la absorción de nutrientes, el crecimiento de brotes y el rendimiento biológico de las plantas. En este estudio, se investigó el efecto de la inoculación de AMF en los rasgos morfológicos, los contenidos de macro y micronutrientes, el contenido de aceite esencial (EOC) y el rendimiento de aceite esencial (EOY) de la lavanda (L.), bajo estrés de HM (Pb y Ni) en condiciones de invernadero. Los tratamientos realizados fueron los siguientes: inoculación de AMF (5 g kg de suelo) y estrés de HM, incluyendo Pb (150 y 225 mg kg de suelo de Pb(NO)) y Ni (220 y 330 mg kg de suelo de Ni(NO)). Los controles fueron la ausencia de AMF y los tratamientos de HM. Los resultados mostraron que la contaminación con Pb y Ni disminuyó la altura de la planta, el número de ramas, el peso fresco y seco de brotes y raíces, y los contenidos de P, K, Mg, Fe, Zn y Mn. Al mismo tiempo, la inoculación de AMF moduló los efectos adversos de los tratamientos de Pb y Ni. La inoculación de AMF y las concentraciones más bajas de Pb y Ni aumentaron el EOC y el EOY de las plantas de lavanda, mientras que los niveles más altos de HMs redujeron los rasgos morfobiométricos. La inoculación de AMF aumentó los contenidos de Pb y Ni en las raíces. El tratamiento con Pb a 220 mg kg provocó un efecto de estrés mayor que el tratamiento de Ni. En conclusión, los resultados recomiendan la inoculación de AMF como un procedimiento útil para mejorar las respuestas de crecimiento y el EOY de la lavanda en ambientes contaminados con los HMs probados y sugieren que la inoculación de AMF es potencialmente eficiente para mitigar los efectos del estrés de HM.