Los efectos indirectos de la exclusión social en diferentes ámbitos de la vida de las personas han sido escasamente estudiados. La literatura que aborda la exclusión social desde el enfoque de las capacidades es escasa, y aún no se ha implementado una metodología para medir los efectos instrumentales de la exclusión social en la privación de capacidades. Por lo tanto, el objetivo principal de esta investigación es proponer un marco metodológico para cuantificar estos efectos, basado en dos técnicas: modelado de ecuaciones estructurales y análisis de componentes principales. Asimismo, este estudio presenta una aplicación práctica en las áreas vulnerables de la ciudad de Murcia, España. Para obtener los datos, se llevó a cabo un trabajo de campo utilizando 464 cuestionarios. El modelo teorizado fue contrastado estadísticamente, confirmando que no es falso. El estudio reveló que la exclusión social instrumental tuvo un impacto moderado en las privaciones experimentadas por la población estudiada.