Mecanismos moleculares de toxicidad poco explorados
Autores: Arowolo, Olatunbosun; Suvorov, Alexander
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Mecanismos moleculares de toxicidad poco explorados
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Ingeniería Química
Palabras clave
Sesgos sociales
Investigadores
Vías moleculares
Toxicidad
Genes
Exposiciones químicas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 28
Citaciones: Sin citaciones
Los sesgos sociales pueden concentrar la atención de los investigadores en un pequeño número de moléculas/mecanismos bien conocidos, dejando otros poco explorados. De acuerdo con esta perspectiva, central en la toxicología mecanicista hay un rango estrecho de vías moleculares que se asumen como involucradas en una parte significativa de las respuestas a la toxicidad. Sin embargo, no está claro si existen otros mecanismos moleculares que desempeñan un papel importante en los eventos de toxicidad pero que son pasados por alto por la toxicología. Para identificar genes pasados por alto sensibles a exposiciones químicas, utilizamos bases de datos de acceso público. Primero, utilizamos datos sobre las interacciones químico-génicas publicadas para 17,338 genes para estimar su sensibilidad a exposiciones químicas. A continuación, extrajimos datos sobre el número de publicaciones por gen para 19,243 genes humanos de la base de datos Find My Understudied Genes. Se aplicaron umbrales a ambos conjuntos de datos utilizando nuestro algoritmo para identificar genes sensibles a químicos e insensibles a químicos, así como genes bien estudiados y poco explorados. Un total de 1110 genes poco explorados altamente sensibles a exposiciones químicas se utilizaron en análisis de GSEA y Shiny GO para identificar categorías biológicas enriquecidas. El metabolismo de ácidos grasos, aminoácidos y glucosa se identificó como mecanismos moleculares poco explorados sensibles a exposiciones químicas. Estos hallazgos sugieren que se necesita un esfuerzo futuro para descubrir el papel de los xenobióticos en las actuales epidemias de enfermedades metabólicas.
Descripción
Los sesgos sociales pueden concentrar la atención de los investigadores en un pequeño número de moléculas/mecanismos bien conocidos, dejando otros poco explorados. De acuerdo con esta perspectiva, central en la toxicología mecanicista hay un rango estrecho de vías moleculares que se asumen como involucradas en una parte significativa de las respuestas a la toxicidad. Sin embargo, no está claro si existen otros mecanismos moleculares que desempeñan un papel importante en los eventos de toxicidad pero que son pasados por alto por la toxicología. Para identificar genes pasados por alto sensibles a exposiciones químicas, utilizamos bases de datos de acceso público. Primero, utilizamos datos sobre las interacciones químico-génicas publicadas para 17,338 genes para estimar su sensibilidad a exposiciones químicas. A continuación, extrajimos datos sobre el número de publicaciones por gen para 19,243 genes humanos de la base de datos Find My Understudied Genes. Se aplicaron umbrales a ambos conjuntos de datos utilizando nuestro algoritmo para identificar genes sensibles a químicos e insensibles a químicos, así como genes bien estudiados y poco explorados. Un total de 1110 genes poco explorados altamente sensibles a exposiciones químicas se utilizaron en análisis de GSEA y Shiny GO para identificar categorías biológicas enriquecidas. El metabolismo de ácidos grasos, aminoácidos y glucosa se identificó como mecanismos moleculares poco explorados sensibles a exposiciones químicas. Estos hallazgos sugieren que se necesita un esfuerzo futuro para descubrir el papel de los xenobióticos en las actuales epidemias de enfermedades metabólicas.