Un mecanismo basado en la estructura para la acción desnaturalizante de la urea, el ion guanidinio y el ion tiocianato
Autores: Paladino, Antonella; Balasco, Nicole; Vitagliano, Luigi; Graziano, Giuseppe
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Un mecanismo basado en la estructura para la acción desnaturalizante de la urea, el ion guanidinio y el ion tiocianato
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Estructuras de proteínas
Moléculas de urea
Enlaces de hidrógeno
Contactos de van der Waals
Desnaturalizantes
Poder desnaturalizante
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
Un análisis exhaustivo de todas las estructuras de proteínas depositadas en el Banco de Datos de Proteínas, realizado aquí, ha permitido la identificación de cientos de moléculas de urea unidas a proteínas y la caracterización estructural de dichos sitios de unión. Se ha observado que, aunque las moléculas de urea están en gran medida involucradas en enlaces de hidrógeno tanto con la cadena principal como con las cadenas laterales, también son capaces de hacer contactos de van der Waals con grupos no polares. Dado que hallazgos similares también se han reportado previamente para guanidinio y tiocianato, esta observación sugiere que la promiscuidad es una propiedad general de los desnaturalizantes de proteínas. Los datos presentes brindan un fuerte apoyo a un mecanismo basado en las interacciones directas entre el desnaturalizante y la proteína con un modelo de unión del desnaturalizante a sitios iguales e independientes. En este marco general, nuestras investigaciones también destacan algunas ideas interesantes sobre el diferente poder desnaturalizante de la urea en comparación con guanidinio/tiocianato.
Descripción
Un análisis exhaustivo de todas las estructuras de proteínas depositadas en el Banco de Datos de Proteínas, realizado aquí, ha permitido la identificación de cientos de moléculas de urea unidas a proteínas y la caracterización estructural de dichos sitios de unión. Se ha observado que, aunque las moléculas de urea están en gran medida involucradas en enlaces de hidrógeno tanto con la cadena principal como con las cadenas laterales, también son capaces de hacer contactos de van der Waals con grupos no polares. Dado que hallazgos similares también se han reportado previamente para guanidinio y tiocianato, esta observación sugiere que la promiscuidad es una propiedad general de los desnaturalizantes de proteínas. Los datos presentes brindan un fuerte apoyo a un mecanismo basado en las interacciones directas entre el desnaturalizante y la proteína con un modelo de unión del desnaturalizante a sitios iguales e independientes. En este marco general, nuestras investigaciones también destacan algunas ideas interesantes sobre el diferente poder desnaturalizante de la urea en comparación con guanidinio/tiocianato.