En este estudio, desarrollamos una pipeline computacional llamada MeHA para identificar genes candidatos relacionados con la salud mental en animales dentro de entornos de agricultura intensiva, incluso en ausencia de datos fenotípicos. Al aplicar MeHA a cerdos, identificamos 109 genes candidatos asociados con la memoria, la cognición y el desarrollo neural que también influyen en rasgos como la calidad de la carne. Nuestros hallazgos subrayan la importancia de la investigación genética para elucidar el comportamiento animal, mejorar las prácticas agrícolas y iluminar el bienestar mental tanto en especies porcinas como en humanos. Este trabajo ilustra la conexión crítica entre la genética, el comportamiento y la productividad en la ganadería.