y son, además de, las principales especies de árboles de hoja caduca utilizadas económicamente en Europa. La identificación de estas dos especies es crucial porque difieren en sus demandas ecológicas. Debido a un clima cambiante, los silvicultores deben saber más que nunca qué especies se desempeñarán mejor bajo ciertas condiciones ambientales. La búsqueda de marcadores moleculares diferenciadores entre estas dos especies ya ha durado décadas. Hasta ahora, la diferenciación solo ha sido posible en enfoques con una combinación de varios marcadores moleculares y un análisis estadístico posterior para calcular la probabilidad de ser una u otra especie. Aquí, utilizamos datos de MiSeq Illumina de grupos de y especímenes e identificamos SNPs nucleares e InDels pequeños frente al genoma de referencia. Las variantes de secuencia seleccionadas con una diferencia de frecuencia alélica del 100% entre los dos grupos fueron validadas en un conjunto ampliado de y especímenes, y luego el número de marcadores se redujo deliberadamente al conjunto más pequeño posible para la diferenciación de especies. Una combinación de seis marcadores de cuatro regiones nucleares es suficiente para identificar, o híbridos entre estas dos especies bastante bien y representa un conjunto de marcadores que es rentable y utilizable en cualquier laboratorio.