Los datos de población espacial precisos y exactos son críticos para la asignación de recursos para el desarrollo socioeconómico y para el proceso de toma de decisiones en la gestión ambiental en cualquier país. Sin embargo, este tipo de datos no siempre está disponible directamente, pero se puede estimar a través de análisis estadísticos espaciales. Los datos de estimaciones de población geo-espacializados pueden proporcionar evidencia indispensable para analizar las amenazas ecológicas potenciales de las actividades antropogénicas en cuencas hidrográficas ecológicamente protegidas. En este estudio, aplicamos un mapeo dasimétrico multiclasificado para estimar la distribución geoespacial de la población residencial de JBNERR (una reserva natural de investigación que se encuentra en dos municipios en el sureste de Puerto Rico). Luego analizamos la variación espacial de la población que reside dentro de la cuenca de la reserva durante un período de treinta años, de 1990 a 2010. El resultado mostró que la población aumentó en un 19.5% con una tasa de crecimiento del 0.97%, añadiendo 5583 nuevos habitantes de 1990 a 2010 para toda el área. Donde la mayor densidad de población corresponde a un área urbana desarrollada, con 254.8 +/- 12.3 hab/900 m2 en 1990, 71.2 +/- 7.1 hab/900 m2 en 2000, y 94.0 +/- 4.8 hab/900 m2 en 2010. Fue seguida por pastizales o áreas abiertas que aumentaron su densidad máxima de población de 1990 a 2000, pero disminuyeron de 2000 a 2010, a diferencia de las áreas urbanas. Nuestros métodos y resultados ayudan a evaluar el impacto del crecimiento urbano en áreas ecológicamente frágiles, como el desarrollo urbano en JBNERR, que puede amenazar indirectamente las actividades recreativas y los entornos ecológicos dentro de áreas protegidas.