Mapeo genético de QTL asociados con el peso de 100 granos utilizando una población DH en maíz
Autores: Li, Huawei; Li, Hao; Chen, Jian; Zhang, Xiangbo; Wang, Baobao; Zhi, Shujun; Guan, Haiying; Song, Weibin; Lai, Jinsheng; Zhao, Haiming; Gao, Rixin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Mapeo genético de QTL asociados con el peso de 100 granos utilizando una población DH en maíz
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Base genética
Peso de 100 granos
Loci de rasgos cuantitativos
Población DH
Llamada de SNP
Análisis de QTL
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
El establecimiento del rendimiento de grano es un proceso complejo y la base genética de uno de los componentes de rendimiento más importantes, el peso de 100 granos, sigue siendo en gran medida desconocida. Aquí, empleamos una población de haploides dobles (DH) que contiene 477 líneas, desarrollada a partir de un cruce de dos líneas inbred élite de maíz, PHBA6 y Chang7-2, para identificar loci de rasgos cuantitativos (QTL) relacionados con el peso de 100 granos. Los fenotipos de la población DH se adquirieron durante tres años en dos ubicaciones diferentes, mientras que las líneas DH fueron genotipadas mediante tecnología de secuenciación de próxima generación de secuenciación de ARN de extremo 3 masivamente paralelo (MP3RNA-seq). Finalmente, se preservaron 28,874 SNPs de 436 líneas DH después de la llamada y filtrado de SNP, y se construyó un mapa genético con una longitud de 837 cM. Luego, se realizó un análisis de QTL de un solo ambiente utilizando el programa R/qtl, y se encontró que se identificaron un total de 17 QTL relacionados con el peso de 100 granos y se distribuyeron por todo el genoma, excepto en los cromosomas 5 y 6. La variación fenotípica total explicada por los QTL detectados en tres ambientes diferentes (BJ2016, BJ2107 y HN2018) fue del 22.2%, 32.9% y 51.38%, respectivamente. Entre estos QTL, tres de ellos se identificaron en diferentes ambientes como QTL ambientalmente estables y explicaron más del 10% de la varianza fenotípica cada uno. En conjunto, los resultados proporcionados en este estudio revelaron preliminarmente la base genética del peso de 100 granos y mejorarán la cría molecular para rasgos clave relacionados con el grano en maíz.
Descripción
El establecimiento del rendimiento de grano es un proceso complejo y la base genética de uno de los componentes de rendimiento más importantes, el peso de 100 granos, sigue siendo en gran medida desconocida. Aquí, empleamos una población de haploides dobles (DH) que contiene 477 líneas, desarrollada a partir de un cruce de dos líneas inbred élite de maíz, PHBA6 y Chang7-2, para identificar loci de rasgos cuantitativos (QTL) relacionados con el peso de 100 granos. Los fenotipos de la población DH se adquirieron durante tres años en dos ubicaciones diferentes, mientras que las líneas DH fueron genotipadas mediante tecnología de secuenciación de próxima generación de secuenciación de ARN de extremo 3 masivamente paralelo (MP3RNA-seq). Finalmente, se preservaron 28,874 SNPs de 436 líneas DH después de la llamada y filtrado de SNP, y se construyó un mapa genético con una longitud de 837 cM. Luego, se realizó un análisis de QTL de un solo ambiente utilizando el programa R/qtl, y se encontró que se identificaron un total de 17 QTL relacionados con el peso de 100 granos y se distribuyeron por todo el genoma, excepto en los cromosomas 5 y 6. La variación fenotípica total explicada por los QTL detectados en tres ambientes diferentes (BJ2016, BJ2107 y HN2018) fue del 22.2%, 32.9% y 51.38%, respectivamente. Entre estos QTL, tres de ellos se identificaron en diferentes ambientes como QTL ambientalmente estables y explicaron más del 10% de la varianza fenotípica cada uno. En conjunto, los resultados proporcionados en este estudio revelaron preliminarmente la base genética del peso de 100 granos y mejorarán la cría molecular para rasgos clave relacionados con el grano en maíz.