La interfaz cerebro-computadora se ha aplicado en una variedad de dominios que incluyen rehabilitación, neuroprótesis y neuroretroalimentación. Las técnicas de neuroimagen proporcionan información sobre los aspectos estructurales y funcionales del cerebro. Existe la necesidad de identificar, mapear y comprender las diversas áreas estructurales del cerebro junto con sus roles activos funcionales para el diseño preciso y eficiente de una interfaz cerebro-computadora. En esta revisión, las áreas funcionalmente activas del cerebro son analizadas mediante el análisis de la investigación disponible en la literatura sobre la interfaz cerebro-computadora en conjunto con experimentos de neuroimagen. Esta revisión primero ofrece una visión general de varios enfoques de la interfaz cerebro-computadora y los componentes básicos en el sistema BCI y luego discute las áreas funcionales activas del cerebro que se utilizan en la interfaz cerebro-computadora no invasiva realizada con señales hemodinámicas y señales basadas en registros electrofisiológicos. Este documento también analiza varios desafíos y limitaciones en la accesibilidad de BCI para un usuario novato, incluidos problemas de seguridad en el sistema BCI, formas efectivas de superar esos problemas e implementaciones de diseño.