Mapeo fino e identificación de un gen candidato para el rasgo verde brillante en repollo (var.)
Autores: Wang, Peiwen; Li, Ziheng; Zhu, Lin; Cheng, Mozhen; Chen, Xiuling; Wang, Aoxue; Wang, Chao; Zhang, Xiaoxuan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Mapeo fino e identificación de un gen candidato para el rasgo verde brillante en repollo (var.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Cera cuticular
Mutante verde brillante
Análisis genético
Gen candidato
Cromosoma 5
Perfilado del transcriptoma
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
En las plantas superiores, la cera cuticular depositada en la superficie de las células epidérmicas juega un papel importante en la protección de la planta contra estrés biótico y abiótico; sin embargo, el mecanismo molecular de producción de cera cuticular no se comprende completamente. En este estudio, identificamos un mutante verde brillante (98-1030gl) de la línea inbred de col glauca 98-1030. La microscopía electrónica de barrido indicó que la cantidad de cera cuticular en las hojas disminuyó significativamente en 98-1030gl. El análisis genético mostró que el rasgo verde brillante estaba controlado por un solo gen recesivo. El análisis de segregantes agrupados junto con la secuenciación del genoma completo reveló que el gen candidato para el rasgo verde brillante estaba ubicado en 13,860,000-25,070,000 pb (11.21 Mb) en el cromosoma 5. Basado en los datos de resecuenciación de dos padres y la población F2, se desarrollaron marcadores de inserción-deleción y se utilizaron para reducir la región de mapeo candidata. El gen candidato fue luego mapeado en un intervalo de 50.97 kb. Bol026949 pertenece a la familia de proteínas del dominio Agenet/Tudor, cuyos miembros se predice que están involucrados en la remodelación de la cromatina y la transcripción de ARN. El análisis de secuencia mostró que una mutación de polimorfismo de un solo nucleótido (C G) en el segundo exón podría resultar en la terminación prematura de su traducción proteica en 98-1030gl. El análisis filogenético mostró que es relativamente conservado en plantas crucíferas. El perfilado del transcriptoma indicó que podría participar en la producción de cera cuticular regulando los niveles de transcripción de genes involucrados en el proceso celular post-traduccional y la señalización de fitohormonas. Nuestros hallazgos proporcionan una pista importante para desentrañar los mecanismos regulatorios de la producción de cera cuticular en cultivos crucíferos.
Descripción
En las plantas superiores, la cera cuticular depositada en la superficie de las células epidérmicas juega un papel importante en la protección de la planta contra estrés biótico y abiótico; sin embargo, el mecanismo molecular de producción de cera cuticular no se comprende completamente. En este estudio, identificamos un mutante verde brillante (98-1030gl) de la línea inbred de col glauca 98-1030. La microscopía electrónica de barrido indicó que la cantidad de cera cuticular en las hojas disminuyó significativamente en 98-1030gl. El análisis genético mostró que el rasgo verde brillante estaba controlado por un solo gen recesivo. El análisis de segregantes agrupados junto con la secuenciación del genoma completo reveló que el gen candidato para el rasgo verde brillante estaba ubicado en 13,860,000-25,070,000 pb (11.21 Mb) en el cromosoma 5. Basado en los datos de resecuenciación de dos padres y la población F2, se desarrollaron marcadores de inserción-deleción y se utilizaron para reducir la región de mapeo candidata. El gen candidato fue luego mapeado en un intervalo de 50.97 kb. Bol026949 pertenece a la familia de proteínas del dominio Agenet/Tudor, cuyos miembros se predice que están involucrados en la remodelación de la cromatina y la transcripción de ARN. El análisis de secuencia mostró que una mutación de polimorfismo de un solo nucleótido (C G) en el segundo exón podría resultar en la terminación prematura de su traducción proteica en 98-1030gl. El análisis filogenético mostró que es relativamente conservado en plantas crucíferas. El perfilado del transcriptoma indicó que podría participar en la producción de cera cuticular regulando los niveles de transcripción de genes involucrados en el proceso celular post-traduccional y la señalización de fitohormonas. Nuestros hallazgos proporcionan una pista importante para desentrañar los mecanismos regulatorios de la producción de cera cuticular en cultivos crucíferos.