Los arándanos (sect.) son una fuente dietética de ácidos fenólicos, incluyendo el ácido clorogénico (CGA) y compuestos relacionados como el ácido acetilado cafeoilquínico (ACQA) y la cafeoilarbutina (CA). Se sabe que estos compuestos son potentes antioxidantes con posibles beneficios para la salud. Aunque la química de estos compuestos ha sido estudiada extensamente, el análisis genético ha quedado rezagado. Comprender la base genética de rasgos con posibles implicaciones para la salud puede ser de gran utilidad en la mejora de plantas. Al caracterizar la variación genética relacionada con la química de la fruta, los criadores pueden hacer un uso más eficiente de la diversidad vegetal para desarrollar nuevos cultivares con mayores concentraciones de estos compuestos potencialmente beneficiosos. Utilizando una gran población F1 interespecífica, desarrollada a partir de un cruce entre la variedad templada y la subtropical, con 1025 individuos genotipados utilizando métodos de genotipado por secuenciación, de los cuales 289 fueron fenotipados para el contenido de ácidos fenólicos, con datos recopilados entre 2019 y 2020, hemos identificado loci asociados con el contenido de ácidos fenólicos. Los loci para los compuestos se agruparon en el brazo proximal de Vc02, lo que sugiere que un solo gen o varios genes estrechamente asociados son responsables de la biosíntesis de los cuatro compuestos probados. Dentro de esta región hay múltiples modelos de genes similares a la hidroxi-cinamoyl CoA shikimato/quinate hidroxi-cinamoyltransferasa (HCT) y UDP glucosa:cinnamato glucosil transferasa (UGCT), genes que se sabe que están involucrados en la vía de biosíntesis del CGA. Loci adicionales en Vc07 y Vc12 se asociaron con el contenido de cafeoilarbutina, lo que sugiere una biosíntesis más complicada de ese compuesto.