Los genes candidatos relacionados con los rasgos de la altura del primer vástago (FPH) en plantas de haba son cruciales para la cría mecanizada. Sin embargo, los informes sobre el mapeo del locus del rasgo cuantitativo (QTL) relacionado con la FPH de la haba son escasos, lo que limita en cierta medida el desarrollo de alta calidad de la industria de la haba. La identificación y selección de genes candidatos relacionados con FPH es extremadamente urgente para el avance de la cría mecanizada de haba. En este estudio, se construyó un mapa de ligamiento genético de alta densidad utilizando genotipado por secuenciación (GBS) de una población F y se identificaron QTL (genes) relacionados con FPH. El mapa de ligamiento genético contenía siete grupos de ligamiento con 3012 marcadores de SNP con una longitud total de 4089,13 centimorgan (cM) y una densidad promedio de marcadores de 1,36 cM. Se identificaron treinta y ocho QTL para el primer nodo de vástago (FPN) y FPH (19 cada uno para FPN y FPH). Los 19 QTL asociados con FPN se ubicaron en los cromosomas 1L, 1S, 2, 3, 4, 5 y 6; los 19 QTL asociados con FPH se ubicaron en los cromosomas 1L, 1S, 2, 3, 5 y 6. Hubo un intervalo de co-localización en el cromosoma 6. Al anotar el intervalo de QTL, se identificaron 36 genes que pueden estar relacionados con FPH, estos genes están relacionados con el crecimiento y desarrollo de la planta. Los resultados proporcionan una base para la ubicación precisa de QTL relacionados con FPH y podrían acelerar la cría de variedades de haba adaptadas a la cosecha mecanizada.