La scrapie es una enfermedad fatal en las ovejas que puede verse influenciada por la variación genética natural. Analizamos el perfil genético de las ovejas de Serra da Estrela, una raza portuguesa nativa, para entender cuán comunes son las variantes genéticas protectoras o susceptibles en esta población. Encontramos que muchos animales portaban una forma genética que proporciona resistencia a la scrapie clásica, mientras que las variantes más susceptibles estaban ausentes. También se detectaron varias nuevas mutaciones genéticas, algunas de las cuales pueden desempeñar un papel en cómo se desarrolla la enfermedad. Estos resultados sugieren que estrategias de cría graduales y equilibradas podrían mejorar la resistencia a la scrapie en las ovejas de Serra da Estrela sin reducir su diversidad genética. Fortalecer la salud de esta raza no solo mejora el bienestar animal, sino que también ayuda a preservar un importante recurso cultural y económico para Portugal.