La relación de amiloza a amilopectina en el almidón de grano de maíz es importante para la apariencia, estructura y calidad de los productos alimenticios y su procesamiento. Este estudio tuvo como objetivo identificar loci de rasgos cuantitativos (QTL) que controlan el contenido de amiloza en maíz a través de mapeo de asociación con marcadores de repetición de secuencia simple (SSR) y polimorfismo de un solo nucleótido (SNP). El valor promedio del contenido de amiloza para una población de 80 líneas recombinantes endogámicas (RIL) fue del 8.8 +/- 0.7%, variando de 2.1 a 15.9%. Utilizamos dos análisis diferentes: modelos lineales mixtos (MLM) Q + K y PCA + K, y encontramos 38 (35 SNP y 3 SSR) y 32 (29 SNP y 3 SSR) asociaciones marcador-rasgo (MTA) asociadas con el contenido de amiloza. Un total de 34 (31 SNP y 3 SSR) y 28 (25 SNP y 3 SSR) MTA fueron confirmadas en los MLM Q + K y PCA + K, respectivamente. Este estudio detectó algunos genes candidatos para el contenido de amiloza, como GRMZM2G118690, que codifica un factor de transcripción BBR/BPC, utilizado para el control del desarrollo de semillas y asociado con el contenido de amiloza en arroz. GRMZM5G830776, que codifica una proteína interactuante con SNARE (KEULE), y el marcador no caracterizado PUT-163a-18172151-1376 fueron significativos con un mayor valor de R2 en dos métodos diferentes. GRMZM2G092296 también se asoció significativamente con el contenido de amiloza en este estudio. Este estudio se centró en el contenido de amiloza utilizando una población RIL derivada de líneas endogámicas dentadas y cerosas utilizando marcadores moleculares. Estudios futuros serían beneficiosos para investigar el enlace físico entre los genes de síntesis de almidón utilizando marcadores SNP y SSR, lo que ayudaría a construir un mapa genético más detallado y proporcionar nuevas perspectivas sobre la regulación genética de rasgos agrícolas importantes.