Para determinar el efecto del estrés por baja iluminación (80 mol·m·s) en pepinos, informamos sobre la mejora y cría de variedades tolerantes a la baja iluminación mediante la búsqueda de genes relacionados con la tolerancia a la baja iluminación. En este estudio, se realizó el mapeo del locus del rasgo cuantitativo (QTL) de la altura de la planta de pepino y la longitud del entrenudo bajo estrés por baja iluminación utilizando la población F, empleando secuenciación de fragmentos amplificados de longitud específica (SLAF-seq) y análisis fenotípico. Se construyó un mapa genético con una longitud total de 1114.29 cM a partir de 1,076,599 SNPs, y 2233 marcadores de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) se distribuyeron en siete grupos ligados, con una distancia de mapa promedio de 0.50 cM. Se detectaron dos QTL relacionados con la altura de la planta, y , en Chr.5 y Chr.6, con una tasa de contribución acumulativa del 16.33%. La tasa de contribución (PVE), el valor máximo de LOD, el efecto aditivo (ADD) y el efecto dominante (DOM) de fueron 9.446%, 4.013, 1.005 y 0.563, respectivamente. se ubicaba entre 4,812,907 y 5,159,042 en el genoma Gy14_V2.0 del pepino, con una distancia genética de 0.32 Mb; el intervalo contenía 41 genes candidatos, y se encontraba entre Marker537985 (171.10 cM) y Marker537984 (171.55 cM), un rango que contenía solo un gen candidato. Se encontraron un total de 42 genes candidatos relacionados con la fotosíntesis, el desarrollo del cloroplasto, el estrés abiótico y el crecimiento de la planta en el rango de ubicación asociado con la altura de la planta. Simultáneamente, se detectó un QTL () para la longitud del segundo entrenudo, y los valores máximos de LOD, ADD y DOM fueron 5.689, 0.384 y -0.19, respectivamente. se ubicaba entre 29,572,188 y 29,604,215, con 0.03 Mb en Chr.6 que incluía siete genes candidatos. La función molecular del gen está relacionada con la unión de iones de calcio, lo cual puede estar relacionado con la elongación y el crecimiento de las plantas; sin embargo, la población debe ampliarse aún más para una verificación de localización aceptable. Los resultados de este estudio proporcionan una base preliminar para la búsqueda de genes esenciales de la tolerancia a la baja iluminación de los pepinos e identificar genes de tolerancia a la baja iluminación.