Linden es una planta ornamental prominente que pertenece a la familia Araceae y se cultiva en todo el mundo. Las características morfológicas son cruciales porque impactan significativamente en los valores ornamentales, las propiedades comerciales y la eficiencia en la utilización del espacio en la producción. Sin embargo, hasta la fecha, solo se han realizado algunas investigaciones relacionadas en anthurium. En este estudio, se generó una población de segregación genética F que contiene 160 progenies a través de la hibridación entre variedades de anthurium en maceta y cortadas. Se evaluaron quince rasgos morfológicos que revelaron niveles sustanciales de variación genética y una correlación positiva generalizada. Basado en la tecnología de secuenciación de fragmentos amplificados de longitud específica (SLAF), se desarrollaron 8171 marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP), y se construyó con éxito un mapa de ligamiento de alta densidad de 2202.27 cM de longitud distribuido en 15 grupos de ligamiento, con una distancia promedio de 0.30 cM. Utilizando el método de mapeo de intervalo compuesto inclusivo (ICIM), se identificaron con éxito 59 QTLs relacionados con 15 rasgos morfológicos clave, que explicaron una varianza fenotípica (PVE) que varía del 6.21% al 17.74%. Treinta y tres de esos asociados con 13 rasgos fueron designados como QTLs principales con PVE > 10%. Estos hallazgos ofrecen valiosos conocimientos sobre la base genética de los rasgos cuantitativos y son beneficiosos para la selección asistida por marcadores moleculares (MAS) en la mejora del anthurium.