La secuenciación de fragmentos amplificados de longitud específica (SLAF-seq) es una estrategia de alta resolución desarrollada recientemente para el descubrimiento de genotipado de novo a gran escala de marcadores de polimorfismos de nucleótido único (SNP). En la presente investigación, con el fin de facilitar la reproducción guiada por el genoma en la patata, esta estrategia se utilizó para desarrollar un gran número de marcadores SNP y construir un mapa genético de alta densidad para la patata tetraploide. El ADN genómico extraído de 106 individuos F derivados de un cruce entre dos variedades de patata tetraploides YSP-4 x MIN-021 y sus progenitores se utilizó para secuenciación de alto rendimiento y construcción de biblioteca SLAF. Se obtuvieron un total de 556,71 Gb de datos, que contenían 2269,98 millones de lecturas de extremo pareado, después de la preprocesamiento. Según el análisis bioinformático, se desarrollaron un total de 838,604 etiquetas SLAF, con una profundidad de secuenciación promedio de 26,14 veces para los progenitores y 15,36 veces para la descendencia de cada SLAF, respectivamente. En total, se obtuvieron 113,473 SLAFs polimórficos, de los cuales 7638 SLAFs se clasificaron con éxito en cuatro patrones de segregación. Después del filtrado, se detectaron un total de 7329 marcadores SNP para la construcción del mapa genético. El mapa de ligamiento integrado final de la patata tetraploide incluyó 3001 marcadores SNP en 12 grupos de ligamiento, y cubrió 1415,88 cM, con una distancia promedio de 0,47 cM entre marcadores adyacentes. Hasta donde sabemos, el mapa integrado descrito aquí tiene la mejor cobertura del genoma de la patata y la mayor densidad de marcadores para la patata tetraploide. Este trabajo proporciona una base para futuras ubicaciones de loci de rasgos cuantitativos (QTL), clonación de genes basada en mapas de genes de rasgos importantes y selección asistida por marcadores (MAS) de la patata.