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MAGE: Una herramienta de código abierto para el meta-análisis de estudios de expresión génica

Autores: Tamposis, Ioannis A.; Manios, Georgios A.; Charitou, Theodosia; Vennou, Konstantina E.; Kontou, Panagiota I.; Bagos, Pantelis G.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2022

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Acceso abierto

Artículo científico
2022

MAGE: Una herramienta de código abierto para el meta-análisis de estudios de expresión génica


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Meta-análisis
Expresión génica
Análisis de enriquecimiento funcional
Software de código abierto
Python
Sondas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 19

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
MAGE (Meta-Análisis de Expresión Génica) es un paquete de software de código abierto en Python diseñado para realizar meta-análisis y análisis de enriquecimiento funcional de datos de expresión génica. Incorporamos métodos estándar para el meta-análisis de estudios de expresión génica, errores estándar de bootstrap, correcciones para pruebas múltiples y meta-análisis de múltiples resultados. Es importante destacar que el conjunto de herramientas MAGE incluye características adicionales para la conversión de sondas a identificadores de genes y para realizar análisis de enriquecimiento funcional, con resultados anotados, de términos enriquecidos estadísticamente significativos en varios formatos. Junto con la herramienta en sí, también se desarrolló una infraestructura basada en la web para apoyar las características de este paquete.

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